海祇岛东南遗迹的开启需要解开一系列机关谜题。首先到达遗迹区域后，会发现多个需要激活的机关，这些机关通常与环境或其他机关存在联动关系。仔细观察周围环境，寻找隐藏的开关或触发器是解谜的关键。部分机关需要按照特定顺序激活，而有些则需要使用元素技能触发元素反应才能生效。遗迹中还可能存在数独方块谜题，需要根据方块朝向和顶部石板数量进行数字换算，最终使横列、竖列、斜列之和相等才能解开。
解开机关后，水位会发生变化，这是进入遗迹深处的关键。水位下降后会出现新的通道，需要游泳或攀爬进入。在通道尽头可能会遇到需要启动的墙上机关，这些机关往往被铁门或屏障阻挡。使用雷元素角色激活雷元素方碑或引导雷霆探针至正确方向，可以解除部分封印。部分区域还需要参拜基柱获取雷种子，利用雷种子引导四个雷霆探针解封雷元素柱子。
遗迹内部结构复杂，包含多个解谜环节。有些房间需要通过演奏功能调整墙壁图案，取出中心的乐章并放入装载台。在探索过程中会遇到野伏众等敌人，击败他们才能继续前进。注意打破屏风等可破坏物件，可能隐藏着重要机关或通路。部分区域需要借助雷种子或四叶印快速移动，到达高处启动机关。
最终开启遗迹核心区域需要完成一系列连锁解谜。这可能包括同时激活多个机关、击败特定敌人或完成元素反应挑战。成功解开所有谜题后，遗迹大门会完全开启，露出内部的珍贵宝箱和秘境入口。遗迹探索过程中收集的宝箱往往与解谜进度相关，不要错过任何可探索的角落。
遗迹内的谜题设计注重逻辑性和观察力，建议携带多种元素角色以应对不同挑战。雷元素角色在解谜过程中尤为重要，而风元素角色能帮助快速移动。探索时保持耐心，若遇到困难可重新审视环境细节，大多数谜题都有明确的视觉提示。完成海祇岛遗迹探索不仅能获得丰厚奖励，还能深入了解游戏世界观和背景故事。
